Katolicka Niepubliczna Szkoła Podstawowa Stowarzyszenia Przyjaciół Szkół Katolickich w Smolajnach powstała na bazie zlikwidowanej szkoły samorządowej.
Funkcjonuje od 1 września 2001 roku, jako szkoła sześcioklasowa prowadzona początkowo przez lokalne stowarzyszenie „Nasza Szkoła”.